舰船改造是无尽的拉格朗日中提升战斗力的核心环节，关键在于合理规划技术值分配与系统强化优先级。每艘舰船蓝图都包含武器、装甲、动力等多个可改造系统，技术值的获取主要通过战斗经验积累和特定道具兑换。改造时应优先针对舰船定位强化关键系统，例如输出型舰船侧重武器系统调校，防御型舰船则需优先提升装甲抗性。技术值可随时重置的特性允许玩家根据战局变化灵活调整方案，但需注意武器调校需要消耗特定类型的武器技术，这类资源相对稀缺需谨慎使用。
武器系统的深度改造是提升火力的关键途径，不同武器类型需要对应等级的导弹、火炮或鱼雷技术进行调校。调校过程存在成功率机制，建议优先保证主力舰船的主武器完成高阶强化。新版本扩展的调校功能现已覆盖支援系统等非战斗模块，使得维修舰、工程舰等辅助单位也能通过强化维修效率或采集能力来提升整体舰队效能。部分特殊技术如星盾紧急规避装置能赋予舰船战术级能力，这类改造往往需要结合当前星系的特殊协议条件来激活。
舰船子型号的选择直接影响改造路线的基础数值。同一舰船级的不同子型号可能拥有完全迥异的武器配置和系统特性，例如谷神星级驱逐舰的载机型与支援型就分别对应火力输出和战场维修两种方向。改造前必须充分了解各子型号的初始属性差异，避免资源投入与战术需求产生偏差。部分稀有子型号需要通过活动或特殊途径获取，其改造潜力通常优于基础型号，但相应的资源消耗也会显著增加。
舰队整体改造需要遵循互补原则，单舰极致化改造未必能带来最佳实战效果。建议采用核心舰船重点改造，辅助单位适度强化的策略，例如为主力战列舰投入大量资源进行全方位强化，同时为护航艇等辅助单位保留基础功能性改造。改造过程中还需考虑舰船站位和战斗序列的影响，前排单位通常需要更高的生存能力改造，而中后排单位则更依赖火力与命中属性的提升。不同舰种的指挥值消耗差异也应在资源分配时纳入考量。
后期改造应重点关注星系特殊技术的适配性。这些临时性增强技术能针对特定级别或型号的舰船提供巨额属性加成，但生效条件与当前星系环境紧密相关。合理利用节点指挥协同、铁削节材制造工艺等特殊技术，可在资源消耗不变的前提下显著提升舰船性能。部分技术会带来副作用，需要权衡增益效果与负面影响的平衡点，例如提升结构值的同时增加制造成本的技术就更适合后期资源充裕时采用。
改造效果的最终验证必须通过实战检测。建议在重要战斗前保存多套改造方案，通过模拟战斗或低强度冲突测试不同配置的实际表现。特别注意舰船在承受不同伤害类型时的生存数据，以及火力系统对各类目标的命中率和伤害输出曲线。持续观察战斗回放能发现改造方案的潜在缺陷，例如闪避属性不足或能量抗性偏低等问题，进而进行针对性调整。改造是一个动态优化过程，需要随游戏进程不断迭代更新。
